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MRFRの分析によりますと、日本のマイクロバイオームシーケンシングサービス市場規模は、2024年に9375万米ドルと推定されております。
日本のマイクロバイオームシーケンシングサービス市場は、2025年の1億1,047万米ドルから2035年までに5億7,050万米ドルへ成長し、2025年から2035年までの予測期間において年平均成長率（CAGR）17.84％を示すと予測されています。
主要な市場動向とハイライト
日本のマイクロバイオーム解析サービス市場は、技術進歩と健康に関する知見への消費者関心の高まりを背景に、堅調な成長を遂げております。
- 特に臨床診断分野において、個別化医療への需要が増加しております。
- シーケンシング手法の技術進歩により、マイクロバイオーム解析の精度と効率性が向上しております。
- マイクロバイオーム研究に対する規制面の支援が、この分野におけるイノベーションと投資を促進しております。
- 主な市場推進要因としては、腸内健康への関心の高まりと慢性疾患の増加が挙げられます。
日本のマイクロバイオームシーケンシングサービス市場
主要企業
Illumina (US), Thermo Fisher Scientific (US), Zymo Research (US), Qiagen (DE), Genomatix (DE), Microbiome Insights (CA), Second Genome (US), CosmosID (US)
日本マイクロバイオームシーケンシングサービス市場の動向
マイクロバイオームシーケンシングサービス市場は、ヒトマイクロバイオームが健康と疾患に果たす役割への認識の高まりを背景に、著しい成長を遂げております。日本では、シーケンシング技術とバイオインフォマティクスの進歩により、複雑な微生物群集を分析する能力が向上しております。この進化により、医療、農業、環境モニタリングなど様々な分野でマイクロバイオーム分析への需要が急増しております。研究者や臨床医がマイクロバイオームデータの可能性を認識するにつれ、市場は拡大し、個別化医薬品や疾病予防に向けた革新的なソリューションを提供する見込みです。さらに、日本の規制環境は、マイクロバイオーム研究を臨床実践に統合することを支援する方向へ進化しています。バイオテクノロジーと健康イノベーションの促進を目的とした政府の取り組みは、学術機関と民間企業との連携を促進する可能性があります。この相乗効果により、日本の人口の固有のニーズに合わせた新たな製品やサービスの開発につながるかもしれません。マイクロバイオームシーケンシングサービス市場が成熟を続ける中、健康成果の向上と、微生物が人間の健康に及ぼす影響の理解深化において、重要な役割を果たすことが期待されます。
個別化医療への需要の高まり
マイクロバイオームシーケンシングサービス市場において、個別化医療への関心が高まっています。医療提供者が個々のマイクロバイオームプロファイルに基づいて治療をカスタマイズしようとする中、シーケンシングサービスへの需要は増加する見込みです。この傾向は、患者の固有の生物学的特性に合わせて治療法をカスタマイズする精密医療への広範な移行を反映しています。
シーケンス技術の進歩
シーケンス技術の革新は、マイクロバイオームシーケンスサービス市場を変革しています。次世代シーケンス技術による精度向上とコスト削減により、これらのサービスはより利用しやすくなっています。その結果、日本の研究者や臨床医は、微生物群集に関するより深い知見を得るために、これらの先進技術をますます採用しています。
マイクロバイオーム研究に対する規制面の支援
日本の規制環境は、マイクロバイオーム研究にとってより好ましいものになりつつあります。バイオテクノロジーと健康イノベーションの促進を目的とした政府の取り組みは、マイクロバイオームシーケンシングサービスへの投資を後押しする可能性があります。この支援は官民セクター間の連携強化につながり、この分野のさらなる進展を促進するでしょう。
日本のマイクロバイオームシーケンシングサービス市場の推進要因
腸内健康への関心の高まり
日本国民の腸内健康に対する意識の高まりが、マイクロバイオームシーケンシングサービス市場を牽引しています。消費者は腸内細菌叢が全身の健康に果たす役割についてより理解を深めており、マイクロバイオームデータを分析・解釈するサービスへの需要が急増しています。この傾向はプロバイオティクスや機能性食品の売上増加にも反映されており、2026年までに5,000億円規模に達すると予測されています。個人が自身の腸内健康に関するパーソナライズされた知見を求める中、健康志向の消費者とデータ駆動型ソリューションを求める医療の専門家に対応する形で、マイクロバイオームシーケンシングサービス市場は拡大する見込みです。
研究イニシアチブの拡大
マイクロバイオーム研究の推進に対する日本の取り組みは、マイクロバイオームシーケンシングサービス市場にとって重要な推進要因です。政府および民間セクターによる研究イニシアチブへの投資は、学術機関とバイオテクノロジー企業間のイノベーションと協業を促進しています。例えば、日本政府は2025年に100億円をマイクロバイオーム関連研究プロジェクト支援に割り当てました。この資金はマイクロバイオームの機能と健康への影響に関する理解を深め、シーケンシングサービスの需要増加につながると期待されています。研究が進展するにつれ、栄養学、医薬品、疾病予防など様々な分野での応用拡大が見込まれます。
データ分析へのAI統合
データ分析への人工知能（AI）の統合は、マイクロバイオームシーケンシングサービス市場を変革しています。AI技術は複雑なマイクロバイオームデータの処理と解釈をより効率的に行うために活用され、研究者や臨床医が実用的な知見を得ることを可能にしています。日本では、シーケンシングサービスの精度向上と処理時間の短縮につながるAI駆動型プラットフォームを採用する企業が増加しています。この技術的進歩により、医療機関や研究機関を含むより多くの顧客が惹きつけられ、市場が拡大する可能性があります。データ解釈に革命をもたらすAIの可能性は、マイクロバイオームシーケンシングサービス市場の将来性を示唆しています。
健康に関する知見への消費者需要
健康に関する知見への消費者需要の高まりは、マイクロバイオームシーケンシングサービス市場に大きな影響を与えています。日本の消費者は、自身の健康状態を最適化するため、パーソナライズされた健康情報を求める傾向が強まっています。この傾向は、個人が自身のマイクロバイオーム構成に関する知見を得られる自宅検査キットや消費者向け直接シーケンシングサービスの人気上昇に顕著に表れています。企業がアクセスしやすくユーザーフレンドリーなソリューションの提供に努める中、この需要に応える革新的製品・サービスの市場流入が見込まれます。消費者主導の健康知見へのこの移行は、マイクロバイオームシーケンシングサービス市場の成長をさらに加速させる可能性があります。
慢性疾患の増加傾向
日本における慢性疾患の増加傾向は、マイクロバイオームシーケンスサービス市場の顕著な推進要因です。肥満、糖尿病、炎症性腸疾患などの病態がより一般的になる中、医療専門家は疾患管理におけるマイクロバイオームの役割を探求しています。その結果、これらの病態に対するマイクロバイオームの影響に関する知見を提供できるシーケンスサービスへの需要が高まっています。医療提供者とシーケンスサービス企業との連携が、マイクロバイオーム分析に基づく標的介入法の開発を目指す中で、市場に恩恵をもたらすと予想されます。この傾向は市場の潜在的な成長軌道を示唆しています。
市場セグメントの洞察
技術別：SBL（最大）対 SBS（最速成長）
日本のマイクロバイオームシーケンシングサービス市場において、シーケンシング・バイ・リトリーション（SBL）とシーケンシング・バイ・シンセシス（SBS）の各セグメントは、市場構造において極めて重要な役割を担っております。SBLは確立された主要セグメントとして、市場全体の大きなシェアを占めております。一方、SBSは技術進歩と医療・環境管理など様々な分野での応用拡大に後押しされ、最も成長が速いセグメントとして位置づけられております。これらの技術の成長傾向は、正確かつ効率的なシーケンシング手段に対する強い需要によって促進されています。シーケンシング技術の革新とコスト削減がSBSの採用を促進する一方、SBLが提供する信頼性と包括的な知見は、その重要な市場シェアを維持し続けています。その結果、関係者はこれらのセグメントを注視し、市場の競争力学を再構築する可能性のある変化を予測しています。
技術：SBL（主流）対 SBS（新興）
シーケンシング・バイ・リトリーション（SBL）は、その堅牢な手法により、疾患診断など様々な応用において極めて重要な、遺伝子のシーケンシング結果に対する高い信頼性を保証する点が特徴です。主流技術として、SBLは日本のマイクロバイオームシーケンシングサービス市場において、研究者や医療提供者の間で信頼性に関する確固たる評価を確立しています。一方、合成によるシーケンシング（SBS）は、技術的進歩によりシーケンシング時間の短縮とコスト削減を実現し、急速に台頭しています。その魅力は汎用性にあり、臨床診断から学術研究まで幅広い応用が可能です。これらの技術は共に、マイクロバイオーム研究・分析の未来を形作る重要な要素です。
用途別：消化器疾患（最大）対 腫瘍学（最速成長）
日本のマイクロバイオームシーケンシングサービス市場は多様な応用分野が特徴であり、消化器疾患分野が最大のセグメントを占めています。消化器疾患の有病率上昇と個別医薬品への需要増大により、この分野は一貫して大きな市場シェアを維持しています。これに続き、がん研究の進展と標的療法への注目の高まりを背景に、腫瘍学分野が急成長中の応用分野として台頭しています。本市場の成長傾向は、シーケンシング技術の進歩と、健康・疾患におけるマイクロバイオームの役割に関する理解の深化によって牽引されています。医療提供者や研究者が効果的な治療法開発におけるマイクロバイオーム解析の可能性を認識するにつれ、シーケンシングサービスの需要は増加が見込まれます。特に腫瘍学分野では、革新的な治療戦略と関連研究への資金増加により勢いを増しています。
消化器疾患（主流）対 腫瘍学（新興）
日本におけるマイクロバイオームシーケンシングサービス市場では、消化器疾患が主流の応用分野を占めております。腸の健康や疾患管理との強い関連性から、医療の専門家の関心を集めております。この分野は確立された臨床研究の枠組みと治療プロトコルに支えられ、マイクロバイオームシーケンシング技術の広範な導入が進んでおります。一方、腫瘍学は新興の応用分野として認識されており、マイクロバイオームとがん免疫療法の関連性を探求する研究者や臨床医の関心を集めています。個別化がん治療の急速な発展とシーケンシング能力の飛躍的進歩により、この分野は堅調な成長が見込まれ、医療エコシステムにおける革新的な応用やパートナーシップの機会を創出しています。
主要企業と競争環境
日本のマイクロバイオームシーケンシングサービス市場は、技術の進歩と健康におけるマイクロバイオームの役割への認識の高まりを背景に、活発な競争環境が特徴です。イルミナ（アメリカ）、サーモフィッシャーサイエンティフィック（アメリカ）、キアジェン（ドイツ）などの主要企業は、広範な研究能力と革新的な技術を活用し、市場での地位を強化する最前線に立っています。イルミナ（アメリカ）は製品ラインの拡充とシーケンス精度の向上に注力し、サーモフィッシャーサイエンティフィック（アメリカ）はサービス能力拡大のための戦略的提携を重視しています。キアジェン（ドイツ）は特にアジア地域での拡大を積極的に推進し、高まるマイクロバイオーム分析需要を取り込もうとしています。これらの戦略が相まって、イノベーションと協業に焦点を当てた競争環境が形成されています。
事業戦略面では、各社は製造の現地化とサプライチェーンの最適化により効率向上とコスト削減を図っています。市場構造は中程度の分散状態にあり、複数の企業がシェア獲得を競っています。しかしながら、業界標準の設定や技術革新を牽引する大手企業の影響力は顕著です。この競争構造は、中小企業がイノベーションを起こす余地を残しつつも、事業規模を拡大して効果的に競争するには課題を抱える環境を生み出しています。
2025年10月、イルミナ（アメリカ）は日本の主要研究機関との提携を発表し、先進的なマイクロバイオーム解析技術の開発を進めています。この連携により、イルミナは地域における技術力を強化し、市場リーダーとしての地位を確固たるものとすることが期待されています。本提携の戦略的重要性は、革新を加速させ、地域の研究者や医療提供者が最先端の解析ソリューションにアクセスしやすくする可能性に存します。
2025年9月、サーモフィッシャーサイエンティフィック（アメリカ）は臨床応用向けに特化した新たなマイクロバイオーム解析プラットフォームを発表しました。本プラットフォームは、マイクロバイオームデータに基づく患者の健康状態に関する実用的な知見を医療専門家に提供することを目的としています。このプラットフォームの導入は、マイクロバイオーム解析を臨床実践に統合し、患者ケアと診断を変革する可能性を秘めたサーモフィッシャーの取り組みを象徴するものです。
2025年8月、Qiagen（ドイツ）はマイクロバイオームに特化したスタートアップ企業を買収し、製品ポートフォリオを拡大しました。この買収により、Qiagenの技術的能力が強化され、マイクロバイオーム分野におけるサービス提供範囲が拡大される見込みです。スタートアップの革新的ソリューションを統合することで、Qiagenは競争優位性を強化し、包括的なマイクロバイオーム分析に対する需要の高まりに対応することを目指しています。
2025年11月現在、マイクロバイオームシーケンシングサービス市場の主な動向としては、デジタル化、持続可能性、データ分析における人工知能（AI）の統合への強い注力が挙げられます。企業間では、強みを結集してイノベーションを推進し、サービス提供を改善するため、戦略的提携の重要性が増しています。今後の展望としては、競争の差別化が価格競争から技術革新、サプライチェーンの信頼性、そしてマイクロバイオームデータに対する包括的かつ実用的な知見を提供する能力へと移行していくことが予想されます。
日本マイクロバイオームシーケンシングサービス市場の主要企業には以下が含まれます
産業動向
日本マイクロバイオームシーケンシングサービス市場における最近の動向としては、個別化医療への消費者関心の高まりに伴い、様々な企業による投資と成長が増加しています。特に、GeneWiz社とZymo Research社は、日本市場の需要に合わせた革新的なシーケンスソリューションの提供において最先端を走っています。重要な動きとして、Macrogen社は2023年7月、日本におけるマイクロバイオーム分析能力の拡大を目的としたQiagen社との戦略的提携を発表しました。
さらに、Thermo Fisher Scientific社は2023年8月、日本における事業基盤の強化計画を明らかにし、高度なシーケンス技術に対する需要の高まりに対応する同社の姿勢を示しました。こうした進展により市場は堅調な評価額成長を見せており、各組織はゲノムデータ活用に向けた協業を積極的に模索しています。過去2～3年で、腸内健康に関連するマイクロバイオーム研究の需要が日本で大きく高まり、研究開発（R&D）への注力が加速しています。
イルミナやユーロフィンズ・サイエンティフィックといった企業は、マイクロバイオームシーケンシングサービスの推進において引き続き重要な役割を担っており、日本の遺伝子研究・診断分野の活況ぶりを示しています。
今後の展望
日本のマイクロバイオームシーケンシングサービス市場 将来展望
日本のマイクロバイオームシーケンシングサービス市場は、個別化医療の進展、健康意識の高まり、技術革新を背景に、2024年から2035年にかけて年平均成長率（CAGR）17.84％で成長すると予測されています。
新たな機会は以下の分野に存在します：
- 慢性疾患向け標的型マイクロバイオーム療法の開発
- データ解釈強化のためのAI駆動型分析の統合
- 消費者向けサブスクリプション型マイクロバイオーム検査サービスの拡大
2035年までに、本市場は大幅な成長を達成し、革新的な健康ソリューションのリーダーとしての地位を確立すると予想されます。
市場セグメンテーション
日本マイクロバイオームシーケンシングサービス市場 技術別展望
- 訴訟によるシーケンシング（SBL）
- 合成によるシーケンシング（SBS）
- ショートガンシーケンシング
- 標的遺伝子シーケンシング
- RNAシーケンシング
- その他
日本マイクロバイオームシーケンシングサービス市場 用途別展望
- 消化器疾患
- 感染症
- 中枢神経系疾患
- 腫瘍学
- その他
第1章：概要と主なポイント
1.1 概要
1.1.1 市場概況
1.1.2 主な調査結果
1.1.3 市場セグメンテーション
1.1.4 競争環境
1.1.5 課題と機会
1.1.6 今後の見通し
2 セクションII：調査範囲、方法論および市場構造
2.1 市場導入
2.1.1 定義
2.1.2 調査範囲
2.1.2.1 調査目的
2.1.2.2 前提条件
2.1.2.3 制限事項
2.2 調査方法論
2.2.1 概要
2.2.2 データマイニング
2.2.3 二次調査
2.2.4 一次調査
2.2.4.1 一次インタビュー及び情報収集プロセス
2.2.4.2 一次回答者の内訳
2.2.5 予測モデル
2.2.6 市場規模の推定
2.2.6.1 ボトムアップアプローチ
2.2.6.2 トップダウンアプローチ
2.2.7 データの三角測量
2.2.8 検証
3 第III部：定性分析
3.1 市場動向
3.1.1 概要
3.1.2 推進要因
3.1.3 抑制要因
3.1.4 機会
3.2 市場要因分析
3.2.1 バリューチェーン分析
3.2.2 ポーターの5つの力分析
3.2.2.1 供給者の交渉力
3.2.2.2 購入者の交渉力
3.2.2.3 新規参入の脅威
3.2.2.4 代替品の脅威
3.2.2.5 競合の激しさ
3.2.3 COVID-19の影響分析
3.2.3.1 市場への影響分析
3.2.3.2 地域別影響
3.2.3.3 機会と脅威の分析
4 第4章：定量分析
4.1 技術別建設規模（百万米ドル）
4.1.1 訴訟による配列決定（SBL）
4.1.2 合成による配列決定（SBS）
4.1.3 ショートガンシーケンス
4.1.4 標的遺伝子シーケンス
4.1.5 RNAシーケンス
4.1.6 その他
4.2 アプリケーション別建設規模（百万米ドル）
4.2.1 消化器疾患
4.2.2 感染症
4.2.3 中枢神経系疾患
4.2.4 腫瘍学
4.2.5 その他
5 第5章：競合分析
5.1 競合環境
5.1.1 概要
5.1.2 競合分析
5.1.3 市場シェア分析
5.1.4 構築分野における主要成長戦略
5.1.5 競合ベンチマーキング
5.1.6 開発件数における主要企業
5.1.7 主要な開発動向と成長戦略
5.1.7.1 新製品発売／サービス展開
5.1.7.2 合併・買収
5.1.7.3 合弁事業
5.1.8 主要企業の財務マトリックス
5.1.8.1 売上高および営業利益
5.1.8.2 主要企業の研究開発費（2023年）
5.2 企業プロファイル
5.2.1 イリミナ（アメリカ）
5.2.1.1 財務概要
5.2.1.2 提供製品
5.2.1.3 主要な開発動向
5.2.1.4 SWOT分析
5.2.1.5 主要戦略
5.2.2 サーモフィッシャーサイエンティフィック（アメリカ）
5.2.2.1 財務概要
5.2.2.2 提供製品
5.2.2.3 主要な進展
5.2.2.4 SWOT分析
5.2.2.5 主要戦略
5.2.3 ザイモリサーチ（アメリカ）
5.2.3.1 財務概要
5.2.3.2 提供製品
5.2.3.3 主な展開
5.2.3.4 SWOT分析
5.2.3.5 主要戦略
5.2.4 Qiagen（ドイツ）
5.2.4.1 財務概要
5.2.4.2 提供製品
5.2.4.3 主な展開
5.2.4.4 SWOT分析
5.2.4.5 主要戦略
5.2.5 ゲノマティクス（ドイツ）
5.2.5.1 財務概要
5.2.5.2 提供製品
5.2.5.3 主要な開発動向
5.2.5.4 SWOT分析
5.2.5.5 主要戦略
5.2.6 マイクロバイオーム・インサイト（カナダ）
5.2.6.1 財務概要
5.2.6.2 提供製品
5.2.6.3 主な開発動向
5.2.6.4 SWOT分析
5.2.6.5 主要戦略
5.2.7 セカンド・ゲノム（アメリカ）
5.2.7.1 財務概要
5.2.7.2 提供製品
5.2.7.3 主な開発動向
5.2.7.4 SWOT分析
5.2.7.5 主要戦略
5.2.8 コスモスID（アメリカ）
5.2.8.1 財務概要
5.2.8.2 提供製品
5.2.8.3 主要な動向
5.2.8.4 SWOT分析
5.2.8.5 主要戦略
5.3 付録
5.3.1 参考文献
5.3.2 関連レポート
6 図表一覧
6.1 市場概要
6.2 技術別日本市場分析
6.3 用途別日本市場分析
6.4 建設分野における主要購買基準
6.5 MRFRの調査プロセス
6.6 建設分野におけるDRO分析
6.7 建設分野における推進要因の影響分析
6.8 建設分野における抑制要因の影響分析
6.9 建設分野における供給/バリューチェーン
6.10 建設分野（技術別）、2024年（シェア％）
6.11 建設分野（技術別）、2024年～2035年（百万米ドル）
6.12 建設分野（用途別）、2024年（シェア％）
6.13 用途別建設市場、2024年から2035年（百万米ドル）
6.14 主要競合他社のベンチマーク
7 表一覧
7.1 仮定事項一覧
7.2 日本市場規模の推定値および予測
7.2.1 技術別、2025-2035年（百万米ドル）
7.2.2 用途別、2025-2035年（百万米ドル）
7.3 製品発売／製品開発／承認
7.4 買収／提携
